在这重建的过程中,曾几何时,一个小的宗教信仰开始在避难所居民中发起,这个信仰被冠以“教堂儿童“之名,很快就成为了一个巨大的宗教势力。这个信仰给荒原中的人们以希望,给人们一种目的性,并且使人们找到了自身存在的价值。随着类似于”人人为我,我为人人“这样的口号在视频显示屏上的传播,几乎没用多长时间,整个”家李扶泥轧 “地区决大多数新建的城市都为了“圣堂之子“(Children of Cathedral)组织贡献出至少一所建筑物作为办公室。这种现象就是是上帝重新回到了他的子民之中,至少人们是这样想的。很快他们的主教Mephisto就告诉他们,他们的大教主正在注视着他们的一切所作所为,并且对人们的作法感到很欣慰。大主教们没费什么时间就在人们心目中占据了主要的地位。但是没有一个追随者真正见过大教主。时不时的总要有一个虔诚的追随者被选出来,去参加他从未经历过的朝圣活动,其中曾经有少数的朝圣者对朝圣有过怀疑,但Mephisto根本就不理会这些疑义,他告诉朝圣者们,仪式结束后他们要追随着圣光的方向。虽然这种朝圣仪式在荒原上不断的蔓延,但是这其中还有好多令人质疑的地方。直到很长时间以后“圣堂之子”和大主教的真相才被人们所了解......
最后一个被发现的物种是超级变种人(Super- Mutants)。不幸的是,第一次人类和超级变种人的相与就是一个很令人不满意的遭遇战。这些超级变种人们组成了一支变种人军队,并且在寻找他们的领袖。超级变种人是那么令人难以相信的愚蠢,那么令人难以相信的强壮,但是他们还是能记得某些事情,或多或少的能彼此进行交流。他们似乎在不懈的进行着反抗人类的战争,甚至僵尸们也被他们无情的屠杀。很快一些侦察员回报,在”家李扶泥轧“的一个军事基地中隐藏着大量的变种人军队,这给人们带来了巨大的恐慌。不久一些军事狂热分子成立了钢铁兄弟会(The Brotherhood of Steel)。它是个秘密的社团组织,起初是为了解除变种人的军事威胁。钢铁兄弟会凭着驻扎在军事堡垒和地下掩体的优势而对变种人采取了军事行动。最后,是一个被曾经认为不会有所作为的人成为了超级变种人的首领,他进入了曾经造就超级变种人的军事基地并把它摧毁了。
这个人作为一个地下掩体的居民而在荒原上闻名。在“新加洲共和国” NCR (New California Republic)有一座他的巨大是雕像。甚至在NCR还有一个崇拜他的宗教。正是这个不知名的地下掩体的居民发现了“圣堂之子”组织,超级变种人以及大主教的邪恶的阴谋。事实的真相是大主教是一个非常可怕的变种人,他用F.E.V.病毒(在第三次世界大战时东方战争时代为了化学战争所制造的病毒)将人类变异为超级变种人,通过这种方法他牺牲了人类的智慧而提高人类的肌肉和作战能力,并且他用“圣堂之子”组织中的朝圣者来作实验。大主教给人的第一印象是一个有着两个大头的,飘忽不定的眼神的野兽,他手中的王牌是一颗遗留下来的准备在不测时摧毁整个“圣堂之子”组织的核弹。那个地下掩体的居民给大主教显示了张证明超级变种人不能生育的数据碟片,这令大主教彻底崩溃了,他启动了核弹把他自己和他那一桶桶的F.E.V.病毒炸为了尘埃。